Les œuvres d'Emilie Mayer couvrent un nombre remarquable de ces genres "non féminins" - 8 symphonies, 7 ouvertures de concert (y compris l'ouverture réussie de Faust op. 46), un concerto pour piano, un "Rondo militaire" et une vaste œuvre de musique de chambre pour cordes et piano. Ce qui caractérise la classification chronologique et stylistique des œuvres d'Emilie Mayer, c'est son occupation d'un seul ou de quelques genres sur une longue période. Au début, elle écrivit principalement des lieder avec une voix chantante - tout à fait dans l'esprit de son professeur Loewe. Les 1re et 2e symphonies datent également de son séjour à Stettin dans les années 1840. La Symphonie no. 3 en si mineur, écrite en 1850, révèle un intérêt pour le langage tonal de Beethoven, également perceptible dans les quatuors à cordes. Les huit quatuors à cordes contenus dans le legs ont été écrits avant 1858. Les tendances compositionnelles de Mayer vers Beethoven étaient motivées et soutenues par son professeur Adolf Bernhard Marx, qui exerçait encore une influence considérable sur elle
à cette époque.